Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scaf11E9PZM7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms