Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rsph10bE9PYQ0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms