Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsf1E9PWW9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsf1E9PWW9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsf1E9PWW9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsf1E9PWW9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsf1E9PWW9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rsf1E9PWW9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rsf1E9PWW9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsf1E9PWW9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms