Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trim30bE9PVL6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim30bE9PVL6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms