Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syde2E9PUP1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms