Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430403G16RikD3Z5L4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms