Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim12cD3Z3L3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim12cD3Z3L3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms