Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rexo5D3YW29 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rexo5D3YW29 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rexo5D3YW29 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms