Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc13D3YV10 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms