Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Catsperg2C6KI89 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Catsperg2C6KI89 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms