Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smok3bC0HKC9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms