Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms