Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah3B2RWG3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159 ms