Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc8B2RUS7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Abcc8B2RUS7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms