Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prrt4B2RU40 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prrt4B2RU40 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prrt4B2RU40 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prrt4B2RU40 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt4B2RU40 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt4B2RU40 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt4B2RU40 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt4B2RU40 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prrt4B2RU40 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms