Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrn3B2RS91 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrn3B2RS91 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms