Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arhgap42B2RQE8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms