Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Uhrf1bp1B2KF50 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Uhrf1bp1B2KF50 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms