Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf3B2KF05 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf3B2KF05 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms