Protein–RNA interactions for Protein: B1AX85

6030498E09Rik, RIKEN cDNA 6030498E09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030498E09RikB1AX85 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030498E09RikB1AX85 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms