Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms