Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spocd1B1ASB6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spocd1B1ASB6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms