Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik3B1AS29 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms