Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prr29B1ARI9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms