Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem238A9JSM3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem238A9JSM3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms