Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Atp8b5A3FIN4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Atp8b5A3FIN4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp8b5A3FIN4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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