Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf39A2RT81 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms