Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtf1A2AQ19 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtf1A2AQ19 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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