Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtcflA2APF3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtcflA2APF3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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