Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms