Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramel3A2AHA7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramel3A2AHA7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms