Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930469K13RikA0A286YDB2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms