Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SIX1Q15475 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SIX1Q15475 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms