Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GEN1Q17RS7 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GEN1Q17RS7 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms