Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3550W4VSN7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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