Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc166S4R181 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms