Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CcniQ9Z2V9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcniQ9Z2V9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms