Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn7Q9Z261 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms