Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccne2Q9Z238 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms