Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b1Q9Z1T1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ap3b1Q9Z1T1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms