Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NfkbiaQ9Z1E3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms