Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hmg20bQ9Z104 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms