Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn13Q9Z0S4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms