Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gbp2Q9Z0E6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp2Q9Z0E6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp2Q9Z0E6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp2Q9Z0E6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp2Q9Z0E6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp2Q9Z0E6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp2Q9Z0E6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gbp2Q9Z0E6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms