Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srd5a3Q9WUP4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms