Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh13Q9WTR5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms