Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpv2Q9WTR1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms