Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Plod1Q9R0E2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod1Q9R0E2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms