Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms