Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod2Q9R0B9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod2Q9R0B9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod2Q9R0B9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod2Q9R0B9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod2Q9R0B9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms